Fecha de Creación
En el censo de población de 1887 aparece como Aldea de San Marcos. El 11 de noviembre de 1889 le dieron categoría de Municipio y en la División Política Territorial de 1896 era uno de los Municipios que formaban el Distrito de Sensenti, perteneciendo a Copán.
Historia de Fundación
Mercedes Ocotepeque, es uno de los Dieciséis Municipios que conforma el Departamento de Ocotepeque, fundado con los Distritos de Ocotepeque y de Sensenti, respetivamente; y se encuentra ubicado en el extremo Sur-Este del Departamento de Ocotepeque, sirviendo de Límite internacional el Río Sumpul con la Republica de El Salvador; con el Río Hondo como límite Departamental con el Departamento de Lempira; y Municipal con el Municipio de Cololaca en el mismo Departamento.
Mercedes, antes de su Creación pertenecía al Departamento de Copán, y Fue Fundado por Primera Vez el 11 de octubre de 1869, pero habiendo perdido su Categoría de Municipio por más de 07 Años, se volvió a restablecer como Municipio el 02 de diciembre de 1891, según lo describe su Segundo Titulo.
Significado de su nombre
En honor a su patrona, la virgen de las Mercedes