En el futuro curaremos el cáncer con algoritmos

Un ensayo titulado Inmunoterapia de precisión ha resultado ganador del galardón Michelson Philanthropies & Science Prize for Immunology. Su autor, Aleksandar Obradovic, investigador del Centro Médico Irving de la Universidad de Columbia (EE UU), plantea un enfoque individualizado que identifique las interacciones célula a célula implicadas en la resistencia al tratamiento oncológico con inmunoterapia por medio de algoritmos.

Según detalla Obradovic en su artículo, publicado esta semana en Science, “en la última década, el tratamiento del cáncer se ha visto revolucionado por el auge de la inmunoterapia inhibidora, ya que activa las respuestas inmunitarias antitumorales de forma amplia e independiente de los mecanismos de crecimiento del tumor. No obstante, muchos pacientes no responden a dicha terapia y no se dispone de indicadores fiables del fracaso terapéutico”.

Tratando el cáncer con algoritmos

Por ello, propone una inmunoterapia oncológica más precisa y a medida de cada paciente. Este tratamiento y los datos de secuenciación del ARN unicelular se combinarían con fármacos tradicionales contra el cáncer, mediante dos algoritmos desarrollados por su equipo.

Uno de ellos, infiere la actividad de las proteínas (VIPER) y otro predice la sensibilidad a los medicamentos (ARACNe). El objetivo es identificar grupos de células asociados a la resistencia al tratamiento en distintos tipos de tumores.

“Con la gran cantidad de datos que faltan en los experimentos de secuenciación de ARN unicelular, esto es como resolver un crucigrama”, compara Obradovic. “ARACNe es el diccionario que nos dice qué letras van con qué palabras, y VIPER es el que resuelve el crucigrama, encontrando las palabras correctas incluso cuando faltan la mayoría de las letras”.